四川省疾病預防控制中心是2002年1月11日經(jīng)四川省人民政府批準，在撤銷省衛(wèi)生防疫站、省勞動衛(wèi)生職業(yè)病防治研究所、省寄生蟲病防治研究所、省地方病防治研究所和省結(jié)核病防治所基礎(chǔ)上組建而成，是主要從事疾病預防控制與公共衛(wèi)生技術(shù)管理和服務的省級公益事業(yè)單位。

2014年1月，中心被四川省疾病預防控制機構(gòu)評審委員會評為三級甲等疾病預防控制中心。同時掛有“四川省衛(wèi)生監(jiān)測檢驗中心”和“四川省預防醫(yī)學科學研究院”的牌子。依法承擔疾病預防控制，突發(fā)公共衛(wèi)生事件應急處置、疫情報告及健康相關(guān)因素信息管理、健康危害因素監(jiān)測與干預、實驗室檢測分析與評價、健康教育與健康促進、技術(shù)管理與應用研究指導等公共職能。